Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms