Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc9a3G3X939 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc9a3G3X939 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms