Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ScaperF8VQ70 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScaperF8VQ70 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms