Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5830473C10RikF8VQ07 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms