Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Colca2F8VPY8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Colca2F8VPY8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms