Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28305F6U473 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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