Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngap1F6SEU4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syngap1F6SEU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syngap1F6SEU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms