Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf4E9QAP7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf4E9QAP7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms