Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cald1E9QA15 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cald1E9QA15 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cald1E9QA15 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms