Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc146E9Q9F7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc146E9Q9F7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms