Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ankrd35E9Q9D8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ankrd35E9Q9D8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms