Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp31E9Q6Y8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms