Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FancfE9Q5Z5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms