Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C7

Vmn2r41, Vomeronasal 2, receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r41E9Q5C7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn2r41E9Q5C7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r41E9Q5C7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms