Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DspE9Q557 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DspE9Q557 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms