Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ApobE9Q414 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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