Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NbasE9Q411 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NbasE9Q411 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms