Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms