Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
5430401F13RikE9Q328 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms