Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcc4E9Q236 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcc4E9Q236 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcc4E9Q236 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms