Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc171E9Q1U1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc171E9Q1U1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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