Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp3E9Q1T6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms