Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3893E9Q1I1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3893E9Q1I1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3893E9Q1I1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms