Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms