Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E9Q0B3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
E9Q0B3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E9Q0B3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms