Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm4450E9Q007 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm4450E9Q007 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms