Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd2E9PZM4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd2E9PZM4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms