Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd1E9PZ26 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd1E9PZ26 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd1E9PZ26 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms