Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph10bE9PYQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms