Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp54bE9PXC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp54bE9PXC0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms