Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3lE9PWZ3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl3lE9PWZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl3lE9PWZ3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms