Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc144bE9PVZ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms