Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc175E9PVB3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms