Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcn1E9PVA8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcn1E9PVA8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms