Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifit3bE9PV48 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms