Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde2E9PUP1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde2E9PUP1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms