Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Soga1E1U8D0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Soga1E1U8D0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms