Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim20D3Z7Q2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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