Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hfm1D3Z4R1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hfm1D3Z4R1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms