Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ2

Gm5239, MCG1031578, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5239D3YYZ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5239D3YYZ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5239D3YYZ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms