Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BC048679D3YXE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms