Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms