Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smok3bC0HKC9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms