Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmf1B9EKI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmf1B9EKI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmf1B9EKI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms