Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clip3B9EHT4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clip3B9EHT4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms