Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cspp1B2RX88 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cspp1B2RX88 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms