Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms