Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apba1B2RUJ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms