Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc22a28B2RT89 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms