Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud4B2RRE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms